Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT52Q9Y366 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms