Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms