Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LEMD3Q9Y2U8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LEMD3Q9Y2U8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms