Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP8A1Q9Y2Q0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms