Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms