Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms