Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX12Q9UMY4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms