Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNIKQ9UKE5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms