Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms