Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms