Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms