Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAPAQ9P0L0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms