Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms