Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms