Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms