Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms