Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4Q9NQC3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms