Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms