Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPJQ9HC77 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPJQ9HC77 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms