Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP3Q9H4L4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AL138729.1-201ENST00000406666 664 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms