Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A6AQ9H2W1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms