Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms