Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRTQ9BXP5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRTQ9BXP5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms