Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSCC1Q9BVC3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSCC1Q9BVC3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms