Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNS3Q9BQ31 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms