Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL13Q99616 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms