Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELF4Q99607 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELF4Q99607 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms