Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms