Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms