Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms