Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms