Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDB2Q92466 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDB2Q92466 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms