Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSMEM1Q8WWF3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms