Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF4Q8WV16 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms