Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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