Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PANK1Q8TE04 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANK1Q8TE04 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms