Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2LQ8IYA6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms