Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms