Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF554Q86TJ5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms