Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms