Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO3Q6UWJ1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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