Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms