Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOA5Q6Q788 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms