Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms