Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD2Q6P5Q4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms