Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms