Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms