Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms