Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD4Q5VX71 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD4Q5VX71 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms