Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms